土壤作为枸杞植株的生存基础，供给其生长结实的营养成分和水分。枸杞对土壤的适应性很强，在一般土壤如砂壤土、轻壤土、中壤土或者黏土上均可生长。在有机枸杞生产中，要实现优质高产栽培，最理想的土壤类型是砂壤土和中壤土，尤其是灌淤砂壤土最适宜。这类土壤通透性好，兼容养分的能力强，土壤元素含量丰富。但如果土壤沙性过强，则会造成肥水保持差，容易干旱，导致枸杞生长不良。如果土壤过于黏重，如黏土或黏壤土，虽然含有丰富的营养成分，但是土壤容易板结，造成土壤通透性差，对枸杞根系呼吸和生长发育都不利，枝梢生长缓慢，花果少，颗粒也小。在有机枸杞栽培中，可以结合土壤培肥，对这类土壤进行改良。改良的办法是向枸杞茨园增施有机肥，利用作物碎秸秆或者种植绿肥作物翻入土壤，增加土壤有机质和肥力，增强土壤的通透性，满足有机枸杞生产的土壤条件。
枸杞耐盐碱的能力很强，适应的范围也很广。盐碱地、灰钙土、荒漠土上种植枸杞，生长发育正常，栽种枸杞可以改良环境。有人在海河流域的盐碱地上先种枸杞进行土壤改良，后栽梨树和枣树获得成功。
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